Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Opn5Q6VZZ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn5Q6VZZ7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn5Q6VZZ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms