Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Timd4Q6U7R4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Timd4Q6U7R4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms