Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnip4Q6PHZ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnip4Q6PHZ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms