Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trak1Q6PD31 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Trak1Q6PD31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trak1Q6PD31 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak1Q6PD31 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 313.5 ms