Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prkab2Q6PAM0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms