Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc189Q6NZQ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc189Q6NZQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms