Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hdac4Q6NZM9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Hdac4Q6NZM9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hdac4Q6NZM9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms