Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
U2surpQ6NV83 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
U2surpQ6NV83 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms