Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cep78Q6IRU7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cep78Q6IRU7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms