Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nop58Q6DFW4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Nop58Q6DFW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nop58Q6DFW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms