Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkp4Q68FH0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkp4Q68FH0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pkp4Q68FH0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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