Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spty2d1Q68FG3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spty2d1Q68FG3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spty2d1Q68FG3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms