Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa13Q62424 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxa13Q62424 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxa13Q62424 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
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