Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SypQ62277 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SypQ62277 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SypQ62277 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SypQ62277 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SypQ62277 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SypQ62277 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SypQ62277 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SypQ62277 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SypQ62277 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms