Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ttf1Q62187 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf1Q62187 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms