Protein–RNA interactions for Protein: Q61490

Alcam, CD166 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlcamQ61490 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AlcamQ61490 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AlcamQ61490 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms