Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irf9Q61179 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Irf9Q61179 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irf9Q61179 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms