Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9a1Q61165 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc9a1Q61165 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms