Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Trpc6Q61143 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Trpc6Q61143 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Trpc6Q61143 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Trpc6Q61143 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trpc6Q61143 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Trpc6Q61143 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Trpc6Q61143 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trpc6Q61143 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trpc6Q61143 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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