Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prpf4bQ61136 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf4bQ61136 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf4bQ61136 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms