Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
DbpQ60925 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
DbpQ60925 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DbpQ60925 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DbpQ60925 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms