Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfrsf8Q60846 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfrsf8Q60846 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms