Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Samhd1Q60710 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Samhd1Q60710 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms