Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brip1Q5SXJ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brip1Q5SXJ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brip1Q5SXJ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms