Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam71bQ5STT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam71bQ5STT6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms