Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vps54Q5SPW0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vps54Q5SPW0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms