Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni3kQ5GIG6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnni3kQ5GIG6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnni3kQ5GIG6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.8 ms