Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ecm2Q5FW85 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ecm2Q5FW85 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ecm2Q5FW85 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.8 ms