Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Spag9Q58A65 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Spag9Q58A65 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms