Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q504N7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q504N7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q504N7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q504N7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q504N7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q504N7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q504N7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q504N7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q504N7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q504N7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q504N7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms