Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0K9

Snhg11, Small nucleolar RNA host gene 11, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snhg11Q4G0K9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Snhg11Q4G0K9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snhg11Q4G0K9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms