Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
6430531B16RikQ3V2J1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
6430531B16RikQ3V2J1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms