Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc110Q3V125 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc110Q3V125 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms