Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ldlrad2Q3V0V0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ldlrad2Q3V0V0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms