Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ncbp1Q3UYV9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncbp1Q3UYV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncbp1Q3UYV9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms