Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Capn13Q3UW68 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Capn13Q3UW68 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Capn13Q3UW68 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms