Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb2Q3UUV9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb2Q3UUV9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
H2-Eb2Q3UUV9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-Eb2Q3UUV9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms