Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Chpf2Q3UU43 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chpf2Q3UU43 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms