Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdkl5Q3UTQ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms