Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Klhdc9Q3USL1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Klhdc9Q3USL1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms