Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc190Q3URK1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc190Q3URK1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms