Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cog7Q3UM29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cog7Q3UM29 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cog7Q3UM29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms