Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC1

Rapgef1, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef1Q3UHC1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rapgef1Q3UHC1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rapgef1Q3UHC1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef1Q3UHC1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rapgef1Q3UHC1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef1Q3UHC1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef1Q3UHC1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef1Q3UHC1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rapgef1Q3UHC1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms