Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pid1Q3UBG2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pid1Q3UBG2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms