Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LbrQ3U9G9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LbrQ3U9G9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms