Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q3U6N9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q3U6N9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms