Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VwceQ3U515 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VwceQ3U515 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms