Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccndbp1Q3TVC7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccndbp1Q3TVC7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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