Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calr4Q3TQS0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Calr4Q3TQS0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calr4Q3TQS0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms