Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Riiad1Q3KNY5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Riiad1Q3KNY5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Riiad1Q3KNY5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms